MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD02

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009660	GCT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009660	CAG	2	6	24	29	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009660	CAG	2	6	48	53	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009660	GGC	2	6	84	89	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009660	CAC	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009660	CGG	3	9	113	121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009660	CGG	2	6	130	135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009660	CAG	2	6	141	146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009660	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009660	GGC	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009660	GGC	2	6	213	218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009660	GTG	2	6	235	240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009660	CAG	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009660	GTCG	2	8	297	304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009660	GCG	2	6	307	312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009660	GCGGTG	2	12	343	354	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009660	GGC	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009660	CTG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009660	CG	3	6	378	383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009660	TCG	2	6	386	391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009660	CGGGG	2	10	402	411	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009660	GGT	2	6	420	425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009660	CGC	2	6	466	471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
24	NC_009660	CGG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
25	NC_009660	GCG	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
26	NC_009660	GCG	2	6	543	548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
27	NC_009660	GCT	2	6	565	570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963955
28	NC_009660	CTGG	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	152963955
29	NC_009660	CCG	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
30	NC_009660	GCC	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
31	NC_009660	GGC	2	6	644	649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
32	NC_009660	CGC	2	6	656	661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
33	NC_009660	CCA	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
34	NC_009660	CG	3	6	683	688	0 %	0 %	50 %	50 %	152963955
35	NC_009660	CCA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
36	NC_009660	GC	3	6	729	734	0 %	0 %	50 %	50 %	152963955
37	NC_009660	CGG	3	9	736	744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
38	NC_009660	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
39	NC_009660	CGG	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
40	NC_009660	CCA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
41	NC_009660	G	6	6	881	886	0 %	0 %	100 %	0 %	152963955
42	NC_009660	GCT	2	6	916	921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
43	NC_009660	CGT	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
44	NC_009660	CG	3	6	987	992	0 %	0 %	50 %	50 %	152963956
45	NC_009660	TCC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152963956
46	NC_009660	GC	3	6	1025	1030	0 %	0 %	50 %	50 %	152963956
47	NC_009660	GCA	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963956
48	NC_009660	CGG	3	9	1116	1124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963956
49	NC_009660	CTGG	2	8	1132	1139	0 %	25 %	50 %	25 %	152963956
50	NC_009660	CAG	2	6	1156	1161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963956
51	NC_009660	CTG	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
52	NC_009660	GCG	2	6	1276	1281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963956
53	NC_009660	CCTG	2	8	1320	1327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009660	CAG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009660	GCTG	2	8	1392	1399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009660	CG	3	6	1521	1526	0 %	0 %	50 %	50 %	152963957
57	NC_009660	CCCCGG	2	12	1529	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963957
58	NC_009660	GCG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963957
59	NC_009660	CGCAG	2	10	1581	1590	20 %	0 %	40 %	40 %	152963957
60	NC_009660	CG	3	6	1622	1627	0 %	0 %	50 %	50 %	152963957
61	NC_009660	ACGC	2	8	1640	1647	25 %	0 %	25 %	50 %	152963957
62	NC_009660	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963957
63	NC_009660	GCA	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963957
64	NC_009660	CTG	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963957
65	NC_009660	CGG	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963957
66	NC_009660	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
67	NC_009660	GGTG	2	8	1811	1818	0 %	25 %	75 %	0 %	152963958
68	NC_009660	GGT	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
69	NC_009660	GGT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
70	NC_009660	CGG	2	6	1846	1851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
71	NC_009660	ACC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
72	NC_009660	GGT	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
73	NC_009660	ACC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
74	NC_009660	CAC	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
75	NC_009660	GGT	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
76	NC_009660	CCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
77	NC_009660	GGCCGG	2	12	2047	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
78	NC_009660	CGC	2	6	2063	2068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
79	NC_009660	CCA	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
80	NC_009660	GCC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
81	NC_009660	CGT	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
82	NC_009660	CGC	2	6	2266	2271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
83	NC_009660	CAC	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
84	NC_009660	CTG	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
85	NC_009660	CCA	3	9	2296	2304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
86	NC_009660	CG	3	6	2343	2348	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
87	NC_009660	CGG	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
88	NC_009660	CGC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
89	NC_009660	CCG	2	6	2403	2408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
90	NC_009660	CAC	3	9	2429	2437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
91	NC_009660	GGC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
92	NC_009660	GGC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
93	NC_009660	CAC	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
94	NC_009660	CG	4	8	2593	2600	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
95	NC_009660	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
96	NC_009660	CAC	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
97	NC_009660	CTG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
98	NC_009660	CAG	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
99	NC_009660	ACG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
100	NC_009660	GCC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
101	NC_009660	GGC	2	6	2891	2896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
102	NC_009660	CCCG	2	8	2968	2975	0 %	0 %	25 %	75 %	152963958
103	NC_009660	ACCCC	2	10	2986	2995	20 %	0 %	0 %	80 %	152963958
104	NC_009660	CAC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
105	NC_009660	CGA	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
106	NC_009660	CCG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
107	NC_009660	CGC	2	6	3091	3096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
108	NC_009660	TCC	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152963958
109	NC_009660	CGG	2	6	3169	3174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
110	NC_009660	CGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
111	NC_009660	TGC	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
112	NC_009660	GCC	3	9	3213	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
113	NC_009660	GCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
114	NC_009660	ACG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
115	NC_009660	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
116	NC_009660	CAG	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
117	NC_009660	CGT	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
118	NC_009660	CGT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
119	NC_009660	CGGC	2	8	3512	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
120	NC_009660	GCG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
121	NC_009660	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
122	NC_009660	TCG	2	6	3639	3644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
123	NC_009660	TGG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
124	NC_009660	GC	3	6	3673	3678	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
125	NC_009660	GC	3	6	3680	3685	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
126	NC_009660	CGG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
127	NC_009660	GGCG	2	8	3739	3746	0 %	0 %	75 %	25 %	152963958
128	NC_009660	CTG	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
129	NC_009660	CAG	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
130	NC_009660	GCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
131	NC_009660	GCC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
132	NC_009660	CG	3	6	3873	3878	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
133	NC_009660	GCG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
134	NC_009660	GCA	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
135	NC_009660	AGC	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
136	NC_009660	CGCGG	2	10	3968	3977	0 %	0 %	60 %	40 %	152963958
137	NC_009660	CGT	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
138	NC_009660	CAG	2	6	4007	4012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
139	NC_009660	TGGCCG	2	12	4026	4037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152963958
140	NC_009660	CAG	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
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142	NC_009660	CG	3	6	4102	4107	0 %	0 %	50 %	50 %	152963958
143	NC_009660	GCA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
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152	NC_009660	GCAG	2	8	4482	4489	25 %	0 %	50 %	25 %	152963959
153	NC_009660	CGG	2	6	4551	4556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
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163	NC_009660	CG	3	6	4868	4873	0 %	0 %	50 %	50 %	152963959
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192	NC_009660	GCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963962
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265	NC_009660	GTC	2	6	8171	8176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963963
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267	NC_009660	GCA	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_009660	TACC	2	8	8414	8421	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
269	NC_009660	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963964
270	NC_009660	CCA	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963964
271	NC_009660	CG	3	6	8521	8526	0 %	0 %	50 %	50 %	152963964
272	NC_009660	GCCA	2	8	8543	8550	25 %	0 %	25 %	50 %	152963964
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.